Bakterientherapie
Um eine Ruhephase der Erkrankung möglichst lange zu erhalten, hat sich neuerdings bei manchen Patienten auch eine Behandlung mit einem Bakterienstamm (Escherichia coli, Stamm Nissle 1917) bewährt.

Chirurgische Behandlung
Bei besonders schwerer langjähriger Entzündung des Dickdarms und wenn die Beschwerden auf Medikamente nicht ansprechen, muss eventuell der Dickdarm operativ entfernt werden. Dies hat einen dauerhaften künstlichen Darmausgang oder die Bildung eines künstlichen Stuhlreservoirs (Pouch) zur Folge. Bei dieser zweiten Operationsmethode wird nach Entfernung des Dickdarms der Dünndarm mit dem natürlichen Darmausgang verbunden. Vor dem After wird aus einer Schlinge des Dünndarms das Reservoir gebildet. Dank dieser modernen Operationsmethode können sich die Patienten frei bewegen und gelten als geheilt.